在临床上，CA50的数值偏高，常常可以发生于一些胃肠道恶性肿瘤的病人，此外，还有一部分胰腺癌的病人可以发生CA50偏高的情况。CA50对于胰腺癌诊断的敏感性为60%-90%，特异性大概在50%-90%左右。
除了癌症之外，一些发生在消化道的良性疾病，比如胆管和胰管的炎症、结石等病人，也可以见到CA50偏高的情况，所以CA50不具有独立性诊断癌症的能力。如果CA50偏高，还需要进一步的行影像学检查和胃镜肠镜的检查，发现病变存在。