马尔堡病毒病的症状主要包括发热及毒血症症状、消化系统表现、出血等。
1、发热及毒血症症状：起病急，多于发病数小时后体温迅速上升至40℃以上，表现为稽留热或弛张热，伴畏寒、出汗，持续3-4日后体温下降，第12-14日再次上升并伴有乏力、全身肌肉酸痛、剧烈头痛及表情淡漠等毒血症症状。
2、消化系统表现：发病后第2-3日即可有恶心、呕吐、腹痛、腹泻等消化道症状，严重者可因连续水样便引起脱水，症状可持续1周，可有肝功能异常及胰腺炎等。
3、出血：发病后第4日开始有不同程度的出血，表现为皮肤、黏膜、鼻、牙龈、阴道等出血，呕血、便血、血尿，甚至多脏器出血。