药物流产时疼痛多长时间要根据患者的具体情况而定，个体差异性比较大。对疼痛不敏感的患者，在整个药物流产过程当中都不会感觉到明显的腹痛。对疼痛比较敏感的患者，在第3天服用米索前列醇之后，大约10-15分钟之后就可以出现腹痛。直到患者的孕囊以及大部分蜕膜排出之后，腹痛才会慢慢减轻并消失。对疼痛敏感的患者具体疼痛多长时间，主要与患者用药后多长时间，孕囊能够排出有关系，大多数患者疼痛为30-60分钟左右。如果药物流产过程不顺利，患者的宫颈口非常的紧，或者其他原因导致孕囊不能短时间排除，患者疼痛的时间可以是4-5个小时或者更长。