卵巢巧克力囊肿发生的恶变概率比较小，它发生恶变的症状和普通的卵巢囊肿发生恶变的症状是一样的，会在短时间内囊肿迅速的长大，伴有不规则的阴道的出血，伴有腹胀、腹痛，甚至会有腹水。特别要注意的是在绝经以后，一般有卵巢巧克力囊肿病史的病人的囊肿会缩小，如果绝经以后卵巢巧克力囊肿不缩小，反而增大，这个时候要高度可疑有恶变的可能性。可以通过肿瘤标记物的检查、B超的检查，和其他影像学的检查帮助诊断。所以发生了卵巢巧克力囊肿，患者一定要定期的复查，必要的时候要进行手术治疗。