尖锐湿疣通常不需要血液检查确诊，医生经常会通过仔细观察患者的生殖器和肛门区域辨认尖锐湿疣。如果存在肉眼可见的尖锐湿疣，通常不需要更多的检测就能确定诊断，对于微小的尖锐湿疣，目前可借助于皮肤镜检查帮助诊断。
当尖锐湿疣皮损不典型时，可通过病理组织检查帮助诊断。活检属于一个小手术，由医生选择典型的皮损局部麻醉，用手术刀切除一块小的组织制成病理切片，主要是为了辨别一些不典型皮损。尖锐湿疣虽然是由于人乳头瘤病毒引起，但国际上不推荐使用人乳头瘤病毒的分子生物学检测进行诊断。