感染人类的真菌主要来自外界环境，感染的途径可以通过接触、吸入或食入而致病，少数真菌可以直接致病，多数真菌是在一定条件下才致病，称为条件致病菌。根据真菌入侵组织深浅的不同，临床上把致病真菌分为浅部真菌和深部真菌，浅部真菌主要是皮肤癣菌，侵犯人和动物的皮肤、毛发和甲板引起的这一类称为皮肤癣菌病，简称为癣。浅部真菌病按发病部位又有不同的命名，例如头癣、体癣、股癣、手足癣等等，导致浅部真菌病的原因主要有直接或间接接触。另外，还与宿主的易感性有关，易感的宿主皮肤黏膜上有小的破损，在接触了真菌之后就会患病。深部真菌病一般是指条件致病菌，主要是侵犯免疫力低下的人群。近年来广谱抗生素的应用、糖皮质激素以及免疫抑制剂的应用，包括器官移植以后常规的用免疫抑制剂，还有各种插管技术的开展，艾滋病感染的增多，真菌这种条件致病菌的感染也在不断增加。