肛瘘手术后换药分为几个步骤，包括清洗伤口、彻底消毒，具体如下：
1、清洗伤口：在换药前患者需要使用高锰酸钾或者中药坐浴，清洗手术切口，将残留在切口内的粪便清洗干净。
2、彻底消毒：换药时需要使用聚维酮碘等消毒液，对切口进行彻底的消毒，特别是切口深部的坏死组织需要及时清理，并且在切口内填塞纱条引流，以防止切口内积液而影响切口的愈合。肛瘘换药一般采取在排便后进行，防止换药后患者再次排便而影响手术切口的愈合。
换药是肛瘘术后患者比较重要的一项治疗，通过换药可以加速手术切口的愈合，降低术后的并发症，也可以防止术后出现假性愈合。