膀胱结石的主要症状是排尿疼痛、排尿困难和血尿，疼痛可以是耻骨上和会阴部疼痛，由结石刺激膀胱底部黏膜引起，常伴有尿频和尿急，排尿终末时疼痛加剧，如并发感染，则尿频、尿急更加明显，并可发生血尿和脓尿。
排尿过程中结石常堵塞膀胱出口，使排尿突然中断，并突发剧痛，疼痛可向阴茎和阴茎头以及会阴部放射。排尿中断后，患者需晃动身体或者采取蹲位或卧位，移开堵塞的结石才能够继续排尿，并缓解疼痛。
膀胱壁由于结石的刺激可以出现血尿，并往往表现为终末血尿，尿流中断后再继续排尿也常伴有血尿，老年男性膀胱结石多继发于前列腺增生症，可以同时伴有前列腺增生症的症状。
少数结石，尤其结石较大的，且有下尿路梗阻以及残余尿者可无明显症状，仅在查体中发现。