有些肝内胆管结石并不会引起临床症状，肝内胆管以及肝脏也没有明显的形态以及组织学上的改变。而有些肝内胆管结石可以引起反复发作胆管炎，不仅可以造成胆管狭窄，甚至还有可能引起周围肝脏组织萎缩。长期病变存在甚至还有可能造成胆管细胞性肝癌的发生，因此这种类型的肝内胆管结石是可以造成严重后果，需要及时进行手术治疗。