检测百日咳主要有几个方面：
一、血常规的常规检查，比如白细胞高，以淋巴细胞增高为主。
二、细菌学检查，包括细菌培养、单克隆抗体的印记试验，还有荧光抗体检测也是细菌学检查。
三、血清学检查，血清学检查是测IgM抗体，如果抗体滴度成倍增高，比如四倍以上的增高就有临床意义。
四、目前用的比较多而且敏感度最高、特异性最强的是PCR检测。通过鼻咽分泌物检测百日咳杆菌的DNA，在医院里通常使用此检测手段。