通常情况下微血管减压术后完全恢复需要1-2周，术后第二天即可下床活动。
微血管减压术主要用于三叉神经痛、面肌痉挛、舌咽神经痛等疾病的治疗。常见的并发症是面肌瘫痪、听力减退、脑脊液漏以及无菌性脑膜炎。如果进行微血管减压术后，出现严重的头痛、呕吐、颈部僵硬、伤口疼痛、红肿、发热、面部肌肉无力、听力减退症状，需要及时就医。一般微血管减压术治疗效果比较好，复发率低。个别人会在一年内复发，可能与垫片的移动以及手术垫片的大小不合适有关，可以再次进行手术调整。
微血管减压术因过程在全麻下进行，所以术后应卧床24小时，6小时内不要垫枕头。可翻身或侧卧，四肢要经常活动以预防下肢静脉血栓形成。术后偶有恶心、呕吐现象，呕吐时须把头侧向一方避免误吸，一般24小时内症状会自动消失。