孤独症的治疗是以教育干预为主，药物治疗为辅。孤独症的教育干预训练需要到专门教育机构进行，目的是为了培养孩子生活自理，培养孩子独立生活的能力，减轻孩子残疾程度，改善孩子的生活质量，力争使部分孩子在成年之后能够独立学习、工作和生活。
早期的时候需要家长、老师和医生的密切配合，针对孩子孤独的症状来进行干预训练。需要家庭的充分培养，家长要拿出足够的时间给孩子关爱，多跟孩子做游戏，多领孩子到人群多的地方，增加孩子跟人群的交往。同时要进行行为训练，还要进行专项的语言和感觉统和训练。此外，可以针对性用药物治疗，比如孩子有抑郁症或者焦虑症，或者孩子有注意力缺陷多动症的情况，可以配合相应的药物治疗。