小儿再障做骨髓移植是有一定风险的，若骨髓的各项基因和数值存在有一定差异，则风险是比较大的，因此建议听从医生的意见来决定是否进行该手术。虽然存在有风险，但如果手术能够成功，且在术后5年内没有太大的排斥反应出现，说明病情恢复是不错的。该类型的手术属于大型手术，建议患者到公立医院做治疗，这样治疗会比较有保障些。