如果有卵巢囊肿，同时发现已经怀孕了，对胎儿的影响是不大的。建议首先要排除是否是生理性囊肿所造成的，因为在排卵之后黄体形成，在临床上通过B超检查，也可能会看到的是黄体囊肿。这种情况往往会自行消失，对怀孕本身不会造成影响，如果是病理性的囊肿，在临床上建议除了在孕期定期的给予检查之外，也建议在足月的时候选择剖宫产分娩，同时将卵巢囊肿给予剔除手术。而且在孕期囊肿对怀孕基本上影响不大，建议定期的给予检查就可以了。但是如果出现急性下腹部疼痛，有可能是囊肿出现蒂扭转所引起的，需要手术给予治疗。