在临床上女性得了肛门癌，常常会出现便意频繁、排便次数增加的症状，在大便前肛门可以有下坠感觉，或者里急后重的感觉，在排便之后常会有排便不尽的感觉，晚期病人还可以出现下腹部疼痛。
肛门癌的癌肿比较大，侵犯到肠管造成狭窄，可以导致大便变形或者变细的现象，有的病人甚至可以出现肠梗阻现象，从而导致腹痛、腹胀、肠鸣音亢进等相关临床表现。肛门癌出现溃烂且继发感染的时候大便表面可带有血、脓或者黏液，或者排出黏液脓血便。