结膜炎应该针对病因进行治疗，以局部给药为主，必要时予以全身药物治疗，急性期禁止包扎患眼。常用治疗方式如下：
1、滴眼药水：是治疗结膜炎最基本的给药途径，对于微生物性结膜炎，应该选用敏感的抗细菌或抗病毒眼药水进行治疗，必要时可以根据病原体和药敏试验，选择有效药物进行治疗；
2、眼药膏涂眼：眼药膏可以在夜间使用，能发挥持续治疗作用；
3、结膜囊冲洗：当结膜囊分泌物较多时，可以给予生理盐水或硼酸水冲洗；
4、全身治疗：对于严重的结膜炎，例如淋球菌性结膜炎和衣原体性结膜炎，还需要全身使用抗生素药物进行治疗。