婴儿自闭症的治疗主要是以教育干预为主，药物治疗为辅。因为自闭症的患儿常常存在有多方面的发育障碍、情绪行为异常，所以医生要根据患儿的具体情况，采用教育干预、行为纠正以及药物治疗等相结合的综合干预措施，具体如下：
第一、早期的时候，可以针对孩子自闭症的症状、智力以及行为等问题，在医生和老师综合评估的基础之上，开展个体化的训练方案。
第二、对于重度的孩子，可以采用一对一的方式进行重点培养。
第三、家庭当中，父母要给孩子营造温馨宽松的环境，要多陪伴孩子，多领孩子去接触社会，让孩子逐渐适应社会，开放自己的思维。
第四、对于自闭症的孩子，同时伴有其它情绪异常的时候，可以选择药物治疗。比如有抑郁方面的问题，可以选择抗抑郁药物。孩子有多动症的情况下，可以给孩子口服治疗多动症的药物。