无机磷中毒容易与有机磷中毒、急性胃肠炎相混淆，需要与之鉴别。
1、有机磷中毒
有机磷中毒是指有机磷农药短时大量进入人体后造成的以神经系统损害为主的一系列伤害，主要症状为恶心呕吐、腹痛腹泻、多汗流涎、瞳孔缩小和心跳减慢等毒蕈碱样症状，面、眼睑、舌、四肢和全身横纹肌发生肌纤维颤动，而后发生肌力减退和瘫痪的烟碱样症状，以及头痛头晕、共济失调、抽搐昏迷的中枢神经系统症状。临床根据有无无机磷接触史及毒物鉴定等可鉴别。
2、急性胃肠炎
急性胃肠炎是胃肠黏膜的急性炎症，常见于夏秋季，临床表现主要为恶心呕吐、腹痛腹泻、发热等，一般有自愈倾向，经治疗后基本可以痊愈，通过呕吐物或大便培养、毒物检测等检查可鉴别。