百日咳是长时间的咳嗽性疾病，临床表现因年龄而异。典型的百日咳常见于学龄前儿童和学龄儿童，青少年和成人也并不少见，平均潜伏期7-10日后，出现与普通感冒类似的症状，临床特点有流鼻涕、流泪、轻度咳嗽、低热和不适。1-2周后演变为频繁咳嗽和痉挛，通常在一次呼气时反复发作接连5-10次的咳嗽，咳嗽后频繁呕吐，因此给带来的危害是很显著的，要应用抗生素治疗。
治疗的目的是根除来自鼻咽部感染的细菌，应在早期尽早使用，否则不能实质的改变临床进程，大环内酯类抗生素也就是红霉素、罗红霉素、克拉霉素、阿奇霉素等，是治疗百日咳的首选药物。但是现在已经有耐大环内酯霉素类抗生素的百日咳杆菌，但还是比较少见的，还可以应用磺胺类的药物，替代大环内酯类的药物进行治疗。