腰困出现小肚子疼痛，可能是以下原因引起的：1、泌尿系统疾病，例如泌尿系结石或者泌尿系感染导致的。如果是泌尿系结石，结石进入输尿管，尤其是下输尿管，会出现小腹部疼痛，伴有腰部酸困，甚至有叩击痛的情况，部分病人还会出现血尿的症状。如果是泌尿系感染，除了小腹部以及腰部的症状之外，还会有尿频、尿急、尿痛等情况。2、妇科疾病，如急性或者慢性盆腔炎、痛经、子宫内膜异位症等。也可能是急性的妇科疾病，例如卵巢黄体破裂、卵巢囊肿蒂扭转，甚至宫外孕破裂出血，都可以出现这种情况。