甲状舌管囊肿是先天性的疾病，在胚胎时期甲状腺从舌根位置往下降时，遗留的先天性囊肿样疾病，大多数位置是在舌骨和甲状软骨中间，与管道、舌骨相连或者穿过舌骨，所以手术的关键一定要把囊肿完整切除，把中间连通的管道，包括去掉和舌骨相连的中间部分，否则容易术后导致复发。
另外，曾经做过1-2次手术再复发，治疗的难度比较大，因为周围有粘连、解剖标志不清楚，容易遗留上皮或者管道，就容易导致复发。发现甲状舌管囊肿之后要尽早做手术，以免感染之后或者反复切开，容易造成术后复发以及不容易切干净的并发症。