男孩性早熟的治疗是综合治疗，男孩性早熟是指9岁之前提前出现了第二性征，这个时候还首先鉴别是否是肾上腺皮质功能出现。如果男孩性早熟确定以后，要进一步明确是中枢性性早熟还是周围性性早熟。
首先最常见的原因是肾上腺皮质功能先天性的增生，由于基因的异常，体内糖皮质激素、盐皮质激素合成缺乏，造成雄激素过多。治疗要使用糖皮质激素替代治疗，同时要针对有可能造成矮小进行积极的治疗。如果是颅内的肿瘤或者是生殖细胞肿瘤、睾丸的肿瘤，或者生产β-HCG的肿瘤明确诊断，要切除肿瘤。
由于男孩性早熟有可能造成成年终身高的变矮，治疗原发性的疾病，也要使用包括GnRH类似物，让提前启动的青春期暂时停下来，延迟骨骺的闭合，为身高增长充足的时间，一方面要积极治疗肿瘤，如果没有禁忌症；另一方面要使用GnRH类似物，还要使用生长激素进行治疗。