肾癌预后的最主要因素是病理分期TNM或Robson和瘤细胞分级。一组研究按Robson分期统计五年生存率Ⅰ期75%、Ⅱ期63%、Ⅲ期38%、Ⅳ期11%。
富尔曼核分级是应用最广泛的肾细胞癌组织学分级系统，肿瘤细胞分级是判断肾癌预后的重要依据，是肾癌预后的独立预测因子。嫌色细胞癌比乳头状癌和透明细胞癌预后好，在乳头状癌中Ⅰ型低级别比Ⅱ型高级别预后好，如有肉瘤样改变的愈后则不良。
二倍体瘤细胞比非二倍体瘤细胞预后好。2005年UCLA将肾癌愈后简化为低、中、高危三组，符合T1、核分级1-2分、ECOG评分0的患者划归为低危组，而符合T3、核分级2-4分、ECOG评分≥1分或T4的患者划归为高危组，余则划归为中危组。低、中、高危组五年生存率分别为90%、62%和42%。