儿童孤独症谱系障碍不能治愈，其中有2/3预后较差，成年后无法独立生活，需要终身养护。影响预后的因素主要包括智商，5岁前有无交流性的语言，长期坚持教育训练者预后也相对较好。因为该病属于慢性的过程，预后较差，因此早发现、早诊断、早干预非常重要，并要注重综合治疗。综合治疗包括医学方面的治疗干预、教育训练、行为治疗、家庭治疗的计划和社会心理支持系统的帮助，都非常重要。具体如下：
一、医学方面的治疗干预，目前无特效药可以治愈孤独症。但长期使有可能改善部分患儿的症状，有药物的应用要根据医生的医嘱执行。
二、教育训练，孩子在语言、认知、交流、交往、生活自理等方面存在很多缺陷，因此必须加强教育训练，以促进患儿上述能力的发展。因不同患儿缺陷程度不同，因此必须强调个性化的教育训练，根据自己患儿的具体情况进行训练。
三、行为的治疗，这样的患儿常存在许多不适应性的行为，比如严重的偏食、自伤的习惯。因此需要选择合理的行为矫正方法，加强行为方面的矫正，以改善患儿的不适应行为。
四、家庭治疗的计划，主要包括对患儿的父、母亲进行咨询和指导，使家长了解该障碍，了解孩子发育的特点并掌握照顾、教育训练患儿及矫正患儿不适应行为的基本方法。
五、社会心理支持系统，因为预后较差，很多患儿的父母处于愤怒、痛苦、绝望、孤独之中，这种心态无疑对患儿及家长都会产生很多不利影响。因此建立一定的社会心理支持非常重要，帮助解决困难和心理的问题，是社会上义不容辞的责任。
