扁桃体发炎通常要使用抗生素等药物，比如青霉素类的药物，像阿莫西林或者阿莫西林克拉维酸钾。如果青霉素类的药物过敏，可以口服头孢类的药物，如头孢呋辛或者头孢克洛等等。
如果引起咽痛、发热、化脓，建议可以口服激素类的药物，像泼尼松片等，能够快速的缓解症状，来促进炎症的恢复。如果发热超过38.5℃以上，可以口服布洛芬等消炎、止痛、退热。扁桃体发炎通常是由急性上呼吸道的感染引起，急性期抗炎治疗就可以，如果反复出现慢性的扁桃体炎急性发作，建议要进行扁桃体的切除，以免引起多器官的损伤。