椎间盘突出半夜疼醒是因为髓核突出压迫比较重，或者肌肉劳损比较重，椎间盘突出伴有肌肉劳损和筋膜炎，白天劳累、受凉后夜间会出现锐痛、刺痛。这种情况需要暂时减少活动、卧床休息、热敷，如果有镇痛药，可以用非甾体类消炎镇痛药物，比如扶他林、西乐葆，疼痛严重还可以用弱阿片类的曲马多和阿片类的吗啡，后两种药物需要在医生的指导下应用。
镇痛阶梯性治疗比较好，疼痛严重的时候，如果是髓核挤压神经根造成水肿比较严重，可以用消肿的甘露醇、甘油果糖，还可以用少量激素，有利于消肿，缓解局部的剧痛。如果检查发现髓核压迫、粘连比较重或髓核比较巨大，挤压神经根严重，这时手术治疗比较好。