急性脑脊髓炎的治疗要针对病因，由感染因素和自身免疫性原因所造成，要积极抗感染治疗，病毒性的给予抗病毒治疗，细菌性的抗细菌治疗，同时要给予激素的治疗，大剂量的激素冲击疗法要在早期尽早应用，还要给予免疫球蛋白、血浆置换的方法来治疗急性脑脊髓炎。
同时，要给予对症治疗，用脱水器、营养神经的药物，以及全身支持对症治疗，改善和避免发生并发症。如果影响呼吸功能，需要上呼吸机保证生命体征的平稳。通过早期积极的病因治疗和对症支持治疗，可以控制好急性脑脊髓炎，避免造成凶险的症状。