脓毒症的治疗最主要的是要给予有效的抗感染治疗，通常急诊患者在三小时之内，重症监护室患者在一小时之内，要开始广谱抗生素的治疗，通常从高级抗生素选起，同时要给予去除感染原治疗，如肝脓肿的患者要进行脓腔穿刺排脓。
对于脓毒症患者出现了血压下降的情况，可以充分的给予晶体液、胶体液补液治疗，如果血压上升不明显，可给予去甲肾上腺素、多巴胺、多巴酚丁胺等血管活性药物进行升压治疗，对于补液及血管活性药物仍不能维持血压的患者，可以短期内给予小剂量的糖皮质激素。此外，如果对于脓毒症患者出现呼吸衰竭，可以给予机械通气辅助治疗。