脑外伤后综合征是因为脑外伤以后器质性的问题已经完全恢复，但还存在头部不适症状，跟脑外伤后的创伤影响，也叫创伤后综合征，或者引起的神经递质功能紊乱有关系。一般要通过对症治疗为主的调整，还结合心理治疗，主要是通过调整心态，告诉患者这种情况不是因为脑外伤本身造成，是因为脑外伤后造成的心理影响和脑神经递质的异常引起。
再给予药物对症治疗，治疗头痛、头晕的症状，还要治疗调整神经递质的药物。主要有5-羟色胺再摄取抑制剂和去甲肾上腺素再摄取抑制剂，来治疗和调整因为脑外伤引起的神经递质功能紊乱，以及出现的情绪障碍、躯体障碍症状，以及可能出现的睡眠障碍症状。