治疗妇科滴虫的药物有甲硝唑片，可以口服，也可以直接塞入阴道给药。甲硝唑片又叫灭滴灵，具有抗滴虫的作用，还具有抗厌氧菌的作用。也可以使用保妇康凝胶，对于妇科滴虫霉菌和细菌都有治疗作用。
外用的药物还有高锰酸钾溶液，使用高锰酸钾溶液时，要注意药物的浓度。还有很多新兴的外用药，比如有甲硝唑栓剂和消糜栓等。
女性感染滴虫以后是需要规范治疗的，现在治疗滴虫的外用药有很多种，一般只需要一种到两种联合使用就可以。从检测出有滴虫的第一天起，需要连续一周的时间使用甲硝唑片或者是甲硝唑栓剂外治，甲硝唑栓剂使用比较方便。