生化妊娠本身不会对下次妊娠造成影响，不影响子宫内膜及输卵管功能，对排卵也没有干扰。
生化妊娠更接近于一次正常月经，对机体影响很小。但如果女性连续两次出现流产，包括生化妊娠，要积极查找原因。对于连续多次流产者，大部分是胚胎自身发育异常导致，但需要做B超检查，除外子宫畸形和肿瘤性疾病，比如纵隔子宫或者子宫肌瘤，有时也会导致多次流产，通常需要手术矫正。同时要检查女性免疫功能，有时女性免疫异常也会导致多次流产，比如系统性红斑狼疮、抗磷脂综合征。抗磷脂综合征的女性下次妊娠之后要注意给予抗凝治疗。
生化妊娠流产之后会有出血现象，可能会存在8-10天，因此患者应注意观察。如果10天之后还存在持续性出血，一定要去医院复查彩超，必要时进行药物治疗。女性应注意休息，前20天不做任何重体力劳动和工作。如果需要再次备孕，可进行优生优育的检查。