阿戈美拉汀之所以要晚上吃，与此药的作用机制有关。阿戈美拉汀是特异性的褪黑素受体激动剂。人体的褪黑素分泌有昼夜节律，当夜幕降临，光线刺激减弱之后褪黑素的活性会增加。夜间褪黑素的高低会直接影响睡眠质量，褪黑素水平降低也会导致人体抑郁。阿戈美拉汀通过调整褪黑素节律改善抑郁症所伴发的睡眠障碍，可以调整人体的生物节律紊乱。比如白天没有精神，白天嗜睡以及食欲下降等。