肾盂肾炎分急性和慢性，临床表现有不同。急性肾盂肾炎最多见，临床常见表现单侧腰痛、畏寒、发热、乏力。
多数患者伴有尿频、尿急、尿痛，少见肉眼血尿，极少数患者仅有畏寒、发热的表现，易误认为感冒，做尿常规检查可帮助诊断。
严重急性肾盂肾炎可出现发热不退、血压偏低、感染性休克等并发症。慢性肾盂肾炎的泌尿系统表现不典型，可表现为长期腰部不适、腰痛、尿频不适、夜尿增多、贫血、血压升高、乏力等。
急性发作期时有类似急性肾盂肾炎表现，慢性肾盂肾炎可损害肾功能引起慢性肾衰竭。