混合性结缔组织病在治疗方面，主要是针对具体的病情，选择个体化的治疗原则。本病目前是不能根治的，所以往往需要终身治疗，一定要树立战胜疾病的信心，积极的配合治疗。如果出现明显皮疹，可以应用抗疟药，如羟氯喹来进行治疗。当然，还可以联合应用小剂量的糖皮质激素。如果是关节肌肉病变比较明显，或者出现了明显的关节炎症，比如关节肿胀、疼痛，这时候可以加用非甾体抗炎药，比如美洛昔康、塞来昔布等进行治疗。当出现了明显的脏器损害，比如肺间质病变，或者是联合其他如心脏、肾脏出现了血管炎的病变，一般需要大剂量糖皮质激素，联合免疫抑制剂，比如环磷酰胺、硫唑嘌呤、环孢素a等治疗。