尿不净的原因有生理性的原因和病理性的原因，生理性原因可以见于人在精神紧张时或者长期处于寒冷环境当中。
病理性的原因有实证，也有虚证，实证主要见于泌尿系统感染，是由于细菌感染导致的，引起细菌感染的原因是由于长期熬夜上火，吃辛辣、油腻、肥甘、厚腻之品造成的。急性泌尿系统感染的症状，除了有尿不净以外，还有尿急、尿痛的症状，尿不净的实证病因还可以见于有前列腺炎或者前列腺增生的男性。尿不净的虚证病因是由于肾虚导致的，肾虚不能固摄阳气，就会出现尿不净，多见于老年人或者有高血压、糖尿病等慢性疾病的人。尿不净属于功能性的疾病，积极的查找病因可以治愈。