脑膜炎发现得早，治疗得及时，大多数情况下不会有后遗症，个别可能有复发，有可能留下一些遗憾，即有可能留有后遗症。一般后遗症可以有智力方面、精神方面、认知方面可能会出现问题，对于记忆力、思维、情感等可能会有某些障碍。
还可以有脑积水发生，脑脊液的循环出现障碍，也可能有颅神经损害，视觉、听觉等方面的损害，也可能有感觉、运动方面的障碍，如偏瘫、瘫痪、麻木等。还有一种常有的后遗症是脑细胞局部病灶，造成脑细胞的异常放电，即有癫痫的发生，这都是脑膜炎后遗症常见的几种表现。