对于非梗阻性肥厚型心肌病的治疗，主要是针对并发症的治疗，因为非梗阻性肥厚性心肌病，最终都会发展为心力衰竭或者是房颤。对于心力衰竭的治疗，可以吃β受体阻滞剂，例如美托洛尔片或者比索洛尔片，血管紧张素转换酶抑制剂，例如硝苯地平片或者培哚普利片，不选择血管紧张素转换酶抑制剂可以更换为血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂，例如缬沙坦，还有需要用利尿剂可以选择呋塞米片、螺内酯以及洋地黄制剂常用的地高辛片。对于房颤的治疗主要是控制心率、节律以及防止血栓的形成，控制心率和节律可以选择盐酸胺碘酮片，抗凝的药物可以选择华法林或者达比加群酯等。对于药物效果不好的患者，其实也可以选择手术治疗，比如植入起搏器治疗。