慢性扁桃体炎大多数是细菌感染造成的，应该服用消炎药进行治疗。在临床上最常应用头孢类消炎药，硝基咪唑类消炎药进行治疗，比如头孢呋辛酯、头孢氨苄片、甲硝唑片、奥硝唑片；也可以服用一些中成药治疗，比如连花清瘟胶囊，四季抗病毒合剂，四季感冒片，维C银翘片，这些药物有清热解毒的作用，可以缓解因慢性扁桃体炎引起的咽部不适。