不能用于重症肌无力的抗生素有氨基糖苷类抗生素、青霉素、巴龙霉素、多粘菌素，以及喹诺酮类抗生素等。
除了这些抗生素以外，奎宁、吗啡、地西泮、苯巴比妥等药物，对于重症肌无力的患者也需要禁用或者慎用，这些药物容易抑制神经肌肉接头，从而使重症肌无力患者病情加重或复发，严重者可诱发重症肌无力危象。
因此，重症肌无力患者因感染等到医院就诊时需告知医生自己的病史，医生在选药的时候需考虑以上的药物的禁用。