乙型肝炎发病机制复杂。乙肝病毒侵入人体后，部分被单核吞噬系统清除，成为急性乙肝，剩余的病毒通过血液到达肝脏，病毒包膜与肝细胞包膜融合，导致病毒进入肝细胞开始DNA复制，乙肝病毒DNA进入人细胞核，形成共价闭合环状DNA，称为cccDNA，以此为模板合成前基因组mRNA，以此为模板进入胞浆形成负链DNA，再以此为模板合成正链DNA，两者合成完整的乙肝病毒DNA。乙肝病毒在肝细胞内不断增加复制，成为慢性乙肝病毒携带者。