多数的卵巢囊肿腹腔镜手术对卵巢组织损伤小，对月经周期没有直接的影响，基本还是按照原来的月经周期恢复月经，但有些具体手术情况会改变原有的月经周期。
卵巢囊肿剥除术对卵巢组织会有一定的刺激作用，会引起体内激素水平的变化波动，很多人第二天就会出现阴道出血，有的出血量和时间与平时月经周期相仿，在来月经基本就要一个月以后了，手术对卵巢组织损伤的程度也会导致月经的变化。
如果卵巢组织受到的破坏很少，没有影响到卵巢功能，也就基本不会引起月经的改变。如果留下的卵巢组织受损严重，卵巢的内分泌功能受到明显影响时，就容易引起术后月经的稀发、量少，严重的可以发生闭经。有的卵巢囊肿多次复发，多次手术，残留的正常卵巢组织越来越少，也很容易导致月经的稀少。