慢性肛裂的最佳治疗方法是手术治疗，在临床上肛裂发生主要是因为粪便过于干结，在用力排便时干结的粪便损伤直肠肛管黏膜从而出现裂伤。通常是排便前有剧烈疼痛，排便时或者说刚刚排便完以后疼痛可以获得缓解，紧接着再次出现剧烈的肛门疼痛。
一般来说，对于急性期肛裂通常可以采用保守治疗，也就是便后温水坐浴或者1:5000的高锰酸钾坐浴，局部采用凡士林或者痔疮膏、痔疮栓，就可以获得临床症状的缓解与治愈。慢性期通常是因为肛裂反复发作导致干裂，以及周围组织纤维增生，所以一般需要通过手术治疗手术方式。如果是比较浅的肛裂，可以通过局部切除就可以获得治愈。而对于比较深的如果伤及到肌肉层的肛裂，通常需要行肛门内括约肌切断才能够达到疼痛症状的缓解与治愈。