北京脑外科比较好的脑外科医院有北京天坛医院、首都医科大学宣武医院、中国人民解放军总医院等。 北京天坛医院是一所以神经外科为先导，以神经科学集群为特色，集医、教、研、防为一体的三甲综合医院，是亚洲神经外科临床、科研、教学基地，是中国临床神经科学的引领者，国家神经系统疾病医疗质量控制中心等机构设在该院。 首都医科大学宣武医院是国家神经疾病医学中心、国家首批临床重点专科、首批神经外科专科医师培训基地和中国神经外科援外培训基地，建设有智造实验室、细胞与分子生物学实验室、脊髓损伤与功能重建实验室等研究平台，并与各类科研院校、产业机构合作开展各类科研和探索，在脑血管病、癫痫、脊柱脊髓疾病、脑肿瘤等多种疾病和神经外科先进技术上都进行深入的研究。 中国人民解放军总医院神经外科形成了以颅脑创伤、脑血管病及功能神经外科疾病为特色亚专科的治疗团队，常规开展各类肿瘤、创伤、血管病及功能神经外科疾病的手术治疗，较早开展帕金森病、梅杰综合征、癫痫、抽动症、特发性震颤、痉挛性斜颈等肌张力障碍疾病的脑起搏器手术治疗。