南京治疗抑郁症比较好的公立医院是南京脑科医院，南京脑科医院位于复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》精神类专科第6名。南京脑科医院医学心理科失眠、神经症专科门诊自1992年创立以来，服务范围辐射全国各地，获得了良好的声誉。该门诊拥有多名国内著名专家，技术力量雄厚，经验丰富，对轻中度抑郁症、进食障碍（厌食症、暴食症、神经性呕吐）、心身疾病、应激性障碍及性心理障碍等进行综合治疗。