合肥公立医院有很多，其中比较好的有安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院。这两家医院都登上了复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》，分别位居全国第75名和第95名。其中，安徽医科大学第一附属医院综合实力位列前茅，人才实力位居省医疗机构第一。医院多项技术领先：银屑病和红斑狼疮研究处于国际领先水平；拥有省内首台达芬奇手术机器人；在复杂器官移植领域，达到国内领先水平等。安徽省立医院设备先进、技术力量雄厚，是安徽省唯一一家拥有心、肺、肝、肾、胰、肠、角膜等全部器官（组织）移植资质的医院，连续四年进入全国百强。共有25个学科进入全国学科榜单TOP100，9个学科位列安徽省首位。