阿奇霉素可以用于治疗尿道炎，主要应用于非淋菌性尿道炎的治疗。引起非淋菌性尿道炎的病原微生物主要是沙眼衣原体、解脲支原体和人型支原体，男性主要表现为尿道口少量细胞分泌物以及排尿时疼痛感。女性多数没有症状，可以在妇科检查当中发现阴道异常分泌物。

治疗非淋菌性尿道炎，目前推荐应用阿奇霉素、多西环素，其它替代药物有左氧氟沙星。对于不能使用多西环素的孕妇，推荐左氧氟沙星或者阿奇霉素进行治疗，一般要求和性伴侣同时治疗。

非淋菌性尿道炎在临床上的治愈标准，是临床症状消失，尿道没有异常分泌物，尿液澄清，行尿常规检查时尿沉渣无异常，尿道分泌物和阴道分泌物的拭子检查中，支原体和衣原体应当为阴性。