在没有禁忌症但有适应症的情况下，溶栓治疗最大的风险是出血，但出血的风险因人而异。年龄越大、发病时间越长、梗死面积越大、合并疾病越多，发生出血的几率越高。

还有一些少见的情况，比如因为血管性水肿引起的呼吸道梗阻，这是较少见的并发症。但是脑血管溶栓治疗的风险在术前医生会充分交代，需要平衡治疗风险和收益，决定是否需要进行溶栓治疗。并不是所有的脑血栓患者都需要溶栓治疗，溶栓治疗有严格的适应症，只适用于脑梗死，比如急性脑梗死发生在4.5-6小时之内，而且溶栓治疗还有很多禁忌症。