对于子宫内膜异位症的原因，有很多的学说，但现在大家都认可的学说是经血逆流学说，即来的月经血。
因为月经血可以往下从阴道流出来，但也可以往上走是输卵管，而怀孕不就是精子到输卵管里和卵子见面，所以通路通畅，可以顺着输卵管到达盆腹腔，因为盆腔为最低站，即盆腔最低点。
可能经常有B超检查到盆腔积液，有可能是月经血的回流，尤其是月经后几天去做，子宫内膜细胞与月经血到达盆腔、腹膜表面，有时会在卵巢表面长出来子宫内膜异位的病灶，所以认为是这种原因，还有些免疫缺陷或其他机理。
但公认且比较常用的还是这个学说，而且还有一般能见到有些女性有处女膜闭锁或阴道闭锁，也经常容易发生比较严重的子宫内膜异位症。
也是指经血因为不能顺利流出，只能留在肚子里，反而造成比较严重的子宫内膜异位症，也进一步证实子宫内膜异位症经血逆流学说，是比较认可的学说。
