先天性子宫畸形主要是因为胚胎在形成的过程当中发育异常导致的情况，即生殖器官在分化发育的某一个时段发生了停滞，形成生殖器官畸形的情况。多数情况下不遗传，这是胚胎的形成和发生过程当中产生的情况，并不是一种遗传病，并不是因为遗传因素导致的。

但是子宫畸形有的时候会合并泌尿系统畸形、肛肠系统畸形，也有一部分病人仅仅表现的是先天性子宫畸形。