肾小管间质疾病包括肾盂肾炎，无论是急性肾盂肾炎，还是慢性肾盂肾炎，主要累及肾间质。急性肾盂肾炎通常是感染相关的疾病，因此在肾间质中会有大量中性粒细胞等细胞浸润，导致患者出现各种肾小管功能异常。对于慢性肾盂肾炎来说，更是会累及肾小管和肾间质，部分患者会出现肾小管功能障碍，如肾小管性酸中毒，会出现葡萄糖、氨基酸、磷酸盐，以及尿酸盐的转运障碍。

对于肾盂肾炎的患者来讲，尤其是急性肾盂肾炎，需要在急性期给予正规、积极且足疗程的抗感染治疗，以免疾病迁延不愈后，转成慢性肾盂肾炎。另外慢性肾盂肾炎的患者，会出现慢性的肾间质纤维化、肾小管萎缩，长期以往会影响到肾脏功能，并导致慢性肾功能不全，总之肾盂肾炎被认为是肾小管间质疾病的一种。